落帆亭始建年不详，据地方志记载，宋神宗熙宁初重建。亭附近有杉青闸，杉青闸是嘉兴古运河上控制水流的重要水利设施，《宋史•河渠志》载：“神宗熙宁元年（1063）十月，诏：‘杭之长安，秀之杉青，常之望亭三堰，监护使臣并以管干河塘系街，常同所属今佐，巡视修固，以时启闭’”，由朝廷直接派官员管理，建有官舍。落帆亭是官舍旁的一处名胜，为官吏和客商游憩之所。其时由苏州进嘉兴的帆船，过此必落帆，故称“落帆亭”。清光绪六年（1880）重建，增筑太白亭，旁有花神及闸神像。1921年嘉兴酒业公所出资再修。园内假山玲珑，亭轩幽雅，池塘遍植荷花，清香四溢，风光优美。园林建筑面积2500平方米，现代编写的《江南园林志》将落帆亭列为名园。文革时期，落帆亭遭到严重破坏，现仅存部分假山和太白亭等旧迹。1988年修葺、重筑落帆亭，建筑占地面积约200平方米。落帆亭对面（运河北岸一里）旧有羞墓亭，相传是汉代朱买臣妻崔氏葬所。京剧《马前泼水》即取材于此。落帆亭是大运河的重要遗产点，在历史上有重要地位，具有较高的历史价值。

　　2011年1月，公布为第六批浙江省文物保护单位。