遗址土墩高6米，包含崧泽文化晚期、良渚及马桥文化时期的文化层，土墩周围水田中有厚约0.2—0.95米的灰烬土，曾出土崧泽文化晚期至良渚文化时期的有孔石斧、夹砂红陶釜、泥质灰陶三足器等，器形较特殊，部分规格较高。附近还采集到印纹釉陶圜底、硬陶兽形器等标本。漂母墩遗址是一处文化内涵丰富、年代跨度较大的古文化遗址，其存在年代属新石器时代—青铜时代，是一个研究原始聚落变化发展模式及其渐变过程的重要遗址。

　　2011年1月，公布为第六批浙江省文物保护单位。