根据科技馆结构特点，盐城市科技馆共分为五个功能区域：（1）常设展区：设于主楼二、三层，总建筑面积8210平方米，其中二层为4240平方米，三层为3970平方米。该展区是科技馆基本功能区，也是科技展品集中展示区。（2）临时展区：设于一层，总建筑面积4080平方米。该展区主要为科技恳谈会、经贸洽谈会、科普展示教育、科技产品展览展销等各种主题会展提供服务。（3）培训区：设于四层，建筑面积4820平方米。该区设有可容纳400人的多功能会议厅、200人的学术报告厅各一个、30人的专家会议厅二个及备用展厅等。（4）备用展区：设于地下一层，建筑面积约2390平方米。该展区为备用展厅,亦可作配套服务区。（5）青少年活动中心。建筑面积约7200平方米，主要包括青春剧场、多功能教室、图书馆、餐厅等，该区域主要为青少年健身、娱乐、培养个人兴趣提供场所。（6）影视区：包括设于一层的4D特效影院和设于球体建筑内的穹幕影院。

　　常设展区为科技馆展品展示区，本展区坚持以人为本的指导思想，通过新颖的展示方式、创新的展示理念、互动的展教形式，让公众在体验中感受科学精神、接受科学思想。该展区概括了盐城地方区域特色和经济特点，设置了“科学与发现”、“技术与创新”和“科技与社会”三个主题展区及“儿童科技乐园”、“湿地与海洋”二个特色专题展区。

　　（1）“科学与发现”展区反映了以经典物理学为主的基础科学的内容，向公众揭示客观世界的基本规律，回顾人类认识客观世界的历程。本展区主要展项有全息音响、声聚焦、光学转盘、静电转轮、越转越快等。

　　（2）“技术与创新”展区集中反映了信息时代以计算机技术为核心的高新技术，包括多媒体技术、机电一体化技术、通讯技术、虚拟现实技术等，让公众在一个高新技术的世界里流连忘返，体会高新技术的发展是如何改变我们的认知世界，给观众以强烈的视觉冲击和切身的深刻体验。本展区主要展项有虚拟射击、数字实验室、传感器家族、与主持人对话、机器小狗、悬浮磁球等。

　　（3）“科技与社会”展区主要介绍科学技术对社会和谐发展的促进作用。本展区主要展项有台风体验、科学餐厅、垃圾分类、人体体能综合测试、错觉墙等。

　　（4）“儿童科技乐园”展区通过寓教于乐的展品（项）让孩子在游戏中感知世界，体验科学。本展区主要展项有虚拟捕鱼、科学迷宫、水世界、手工坊、烟雾逃生走廊、模拟驾驶等。

　　（5）“湿地与海洋”展厅通过场景营造、多媒体展示、标本陈列等多种形式，展示盐城特有的沿海滩涂、湖泊和河流三种湿地兼备的自然风光和奥秘，突出“仙鹤神鹿世界，东方湿地之都”的独特风貌，增强人们对美好环境的向往。

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