铜陵淡水豚国家级自然保护区前身为白鱀豚养护场。1985年，原国家环保局为保护国家一级保护动物—白鱀豚决定建立铜陵白鱀豚养护场。随着长江生态环境的日趋恶化，白鱀豚的数量越来越少，同时长江中的其它珍稀动物濒危程度不断增加，急需加强保护。2000年12月22日，安徽省人民政府批准成立了铜陵淡水豚类省级自然保护区，2006年2月，国务院以国办发[2006]9号文正式批准铜陵淡水豚省级自然保护区晋升为国家级自然保护区。

　　铜陵淡水豚国家级自然保护区在我国自然区划中属于华东丘陵区，在动物地理区上属于东洋界华中区。其范围上至枞阳县老洲，下至铜陵县金牛渡，全长58公里，总面积31518ha，其中核心区面积9534ha，缓冲区面积6360ha，实验区面积15624ha。

　　保护区湿地类型为内陆河流湿地，主要是滩涂湿地，其次为毗邻的迳流湿地。保护区滩涂湿地位于江堤和江心洲（包括正在发育的新洲）脚线至长江低水位线之间，其特点为季节性淹没，总面积约为11000ha；迳流湿地主要有与保护区干流直接相通的支流九华河、青通河、土桥河和顺安河等。

　　二、保护区内动植物资源

　　动物资源

　　保护区有浮游动物100多种，占我省已知浮游动物的48.2%，占我国内陆水域浮游动物720种16.5%。底栖动物14目，近90种，其中有软体动物、环节动物、节肢动物。鱼类90余种。从分类组成上来看，以鲤科鱼类为主，占到本区域鱼类物种总数的67%。两栖类12种，约占安徽省两栖类种数的31.6%；爬行类20种，约占安徽省爬行类种数的30%。鸟类200多种，分别隶属于16目50科，其中属国家Ⅰ级重点保护鸟类5种，Ⅱ级重点保护鸟类9种，主要分布在江面、江滩沼泽，江边芦苇丛，树林、灌林丛及农田村舍。

　　植物资源

　　保护区浮游植物计7门80多种。其中硅藻门约占50％；绿藻门约占31％；蓝藻门占9％；甲藻门占5％：裸藻门占4％。金藻门和红藻门各2种，分别占检出种类的1.30％。维管束植物共有90余科500多种，其中有蕨类植物10余种；裸子植物近10种；被子植物500多种。

　　三、主要保护对象

　　白鱀豚：又名白鳍，白旗、白-、青鱀、白夹、江马等。属哺乳纲，鲸目，白鱀豚科。白鱀豚是我国特有的珍稀物种，白鱀豚成体长约1.5-2.5m，体重约70-230kg。白鱀豚具有声呐系统，借此可探知其生活环境的各种目标、获取食物、寻找配偶和逃避敌害等，它的重要活动场所一是水深流急的江心主航道，尤喜具涡流或回流水而又较深处，发水时也到岸边活动；二是江中沙洲的洲头或洲尾附近。白鱀豚约在4-6岁时性成熟，孕期约10-12个月，每胎产仔1头。幼豚产下后靠母豚哺乳为生，一年之内即断奶，开始独立捕捉鱼类为生。目前白鱀豚已功能性灭绝。中国濒危动物红皮书（1998）列为濒危，IUCN(1996)列为CR，CITES(1997)列为附录Ⅰ。

　　长江江豚：鼠海豚科江豚属，为全世界唯一已知的生活在淡水中的江豚种群，形体较白鱀豚为小，头圆，体色暗灰。江豚成体长一般为1.5m左右，大的也可达2m以上，体重差异较大，约50-100kg。体形略呈纺锤形。头圆而钝，额部前凸，吻短阔，口裂较宽，上下颌具铲状的齿。鳍肢呈镰刀状，尾叶较宽阔，呈新月形，整个尾叶呈水平扩展。仅分布于长江中下游、洞庭湖和鄱阳湖等内陆水域，以小型淡水鱼和虾为食。其被国际自然与自然资源保护联盟（IUCN）列为濒危种（EN），同时列入《国际濒危野生动植物种进出口贸易公约》（CITES）附录Ⅰ。据２０１２年统计，长江江豚只有１０４０头，且以每年１３．７３％的速度在减少。