老馆位于合肥市中心地段芜湖路239号，设有矿物晶体精品厅、古生物化石厅、矿物岩石厅、奇石厅四个展厅。新馆位于合肥市政务文化区，常设有序厅、地球厅、生命演化厅、矿物岩石厅、资源与环境厅和恐龙厅六个展厅，陈列部分建筑面积16902平方米。它是一个具有现代化、高科技、独具安徽特色的地质古生物专业博物馆，是安徽省资源、环境、省情展示交流的“窗口”，是珍稀地质矿产标本收藏、研究中心，是国土资源知识普及与青少年科学文化素质教育基地，是集科研、科普、观赏、休闲、娱乐、赏石于一体的理想去处。安徽古生物化石博物馆自成立来开展了多项科普工作，如每年根据全国性的“世界地球日”、“全国土地日”、“科技活动周”、“全国科普日”等活动主题，积极举办国土资源主题科普活动。与多所高校保持密切的科普合作关系，经常深入校园开展科普活动。